MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome

Total Repeats: 18194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002678	TTAA	2	8	1	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002678	GGC	2	6	76	81	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002678	TGC	2	6	156	161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_002678	GC	3	6	177	182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_002678	TCG	2	6	183	188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_002678	TTC	2	6	227	232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_002678	TCG	2	6	237	242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_002678	TCA	2	6	255	260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_002678	CG	3	6	2744	2749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_002678	CGAG	2	8	2788	2795	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_002678	GC	3	6	7506	7511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_002678	GTT	2	6	7594	7599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002678	TGCT	2	8	7630	7637	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_002678	GCGCC	2	10	7663	7672	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_002678	CATC	2	8	7714	7721	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_002678	TCG	2	6	10510	10515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_002678	TGGGG	2	10	10592	10601	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002678	GCG	2	6	12753	12758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_002678	TCT	2	6	12800	12805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_002678	CGC	2	6	12865	12870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_002678	ACG	2	6	12923	12928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_002678	CGC	2	6	14225	14230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_002678	TGGA	2	8	14300	14307	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002678	GCC	2	6	16464	16469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_002678	CGG	2	6	16476	16481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_002678	ACG	2	6	16525	16530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_002678	AGAAA	2	10	16541	16550	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002678	CGA	2	6	18650	18655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_002678	AGAC	2	8	18704	18711	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_002678	CGA	2	6	20866	20871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_002678	CGT	2	6	23770	23775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_002678	CGG	2	6	23802	23807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_002678	A	6	6	23870	23875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002678	A	6	6	23935	23940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002678	GAC	2	6	23982	23987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_002678	CCG	2	6	25182	25187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_002678	CGG	2	6	25198	25203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_002678	CCG	2	6	25321	25326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_002678	CGG	2	6	25334	25339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_002678	GCA	2	6	25353	25358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_002678	TTCGCT	2	12	29065	29076	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_002678	A	6	6	29082	29087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002678	GGCC	2	8	30382	30389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_002678	GCG	2	6	30430	30435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_002678	GCT	2	6	30460	30465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_002678	TTCG	2	8	30500	30507	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_002678	A	6	6	30583	30588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002678	AGGC	2	8	30611	30618	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_002678	GGC	2	6	30650	30655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_002678	CCT	2	6	31645	31650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_002678	GAT	2	6	31807	31812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002678	CGGC	2	8	31823	31830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_002678	GCA	2	6	31995	32000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_002678	CCG	2	6	32045	32050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_002678	ATC	2	6	32177	32182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_002678	GCG	2	6	33947	33952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_002678	CGA	2	6	35390	35395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_002678	AGCC	2	8	35405	35412	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_002678	CCG	3	9	35464	35472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_002678	GCG	2	6	35477	35482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_002678	TTC	2	6	35762	35767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_002678	CGT	2	6	36069	36074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_002678	GCGCC	2	10	36095	36104	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
64	NC_002678	GCC	2	6	36144	36149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_002678	GTTT	2	8	36173	36180	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002678	CCG	2	6	36246	36251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_002678	AGG	2	6	36296	36301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002678	GT	3	6	36336	36341	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002678	GCC	2	6	37008	37013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_002678	GGC	2	6	37020	37025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_002678	TTG	2	6	37030	37035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002678	ACATC	2	10	37089	37098	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_002678	TGC	2	6	37119	37124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_002678	GAA	2	6	38862	38867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002678	TTGC	2	8	40542	40549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_002678	GCG	2	6	40555	40560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_002678	TCT	2	6	40591	40596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_002678	CGG	2	6	40612	40617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_002678	CGA	2	6	40701	40706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_002678	CGGG	2	8	41462	41469	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_002678	GCC	2	6	41480	41485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_002678	TCCG	2	8	41541	41548	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_002678	GC	3	6	41953	41958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_002678	CTCG	2	8	41979	41986	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_002678	GTC	2	6	41989	41994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_002678	ACA	2	6	41996	42001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_002678	AGA	3	9	42029	42037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002678	AGC	2	6	42064	42069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_002678	GCC	2	6	42076	42081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_002678	GCG	2	6	44323	44328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_002678	A	6	6	44406	44411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002678	CAA	2	6	44421	44426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_002678	TGA	2	6	44429	44434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002678	GGGT	2	8	44438	44445	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002678	ATCA	2	8	46212	46219	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_002678	AGAA	2	8	46253	46260	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002678	CGCA	2	8	46925	46932	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_002678	CAG	2	6	46979	46984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_002678	GAA	2	6	47027	47032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002678	CGAGC	2	10	47051	47060	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_002678	GGCC	2	8	47116	47123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_002678	CAC	2	6	47141	47146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_002678	GCG	3	9	47537	47545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_002678	TC	4	8	48242	48249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_002678	ATC	2	6	49047	49052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_002678	GCGA	2	8	49056	49063	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_002678	CCA	2	6	49224	49229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_002678	T	6	6	50332	50337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002678	GGC	2	6	50355	50360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_002678	GCG	2	6	50396	50401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_002678	CGCAG	2	10	50492	50501	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_002678	AC	3	6	50555	50560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_002678	GAC	2	6	50929	50934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_002678	GACT	2	8	50984	50991	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_002678	GGA	2	6	51871	51876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002678	GAA	2	6	53101	53106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002678	TTA	2	6	53109	53114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002678	CGC	2	6	53150	53155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_002678	GC	3	6	53154	53159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_002678	ATT	2	6	53186	53191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002678	TTC	2	6	53212	53217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_002678	AGCG	2	8	53809	53816	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_002678	TG	3	6	53892	53897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002678	CGA	2	6	53910	53915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_002678	TCA	2	6	53920	53925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_002678	GA	3	6	53927	53932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002678	ACG	2	6	53967	53972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_002678	CGG	2	6	53982	53987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_002678	TCA	2	6	54013	54018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_002678	CCG	2	6	54893	54898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_002678	GCA	2	6	56285	56290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_002678	TCCG	2	8	56295	56302	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_002678	AAG	2	6	56314	56319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002678	CGG	2	6	56334	56339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_002678	CCT	2	6	56375	56380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_002678	AGAC	2	8	56386	56393	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_002678	CGT	2	6	57693	57698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_002678	ACC	2	6	57764	57769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_002678	TCC	2	6	60140	60145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_002678	CATGT	2	10	60254	60263	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_002678	AT	3	6	60270	60275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002678	GA	3	6	63069	63074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002678	AGC	2	6	64171	64176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_002678	CG	3	6	64204	64209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_002678	GCT	2	6	66779	66784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_002678	CG	3	6	68575	68580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_002678	CGG	2	6	68587	68592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_002678	CG	3	6	68651	68656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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151	NC_002678	CGC	2	6	68847	68852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_002678	TTTTG	2	10	68943	68952	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_002678	GGT	2	6	68996	69001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_002678	CGA	2	6	69105	69110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_002678	CATTC	2	10	69174	69183	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
160	NC_002678	CCG	3	9	69233	69241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_002678	GCGA	2	8	69268	69275	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
162	NC_002678	CGC	2	6	69279	69284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_002678	GCTGGC	2	12	69303	69314	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_002678	CCG	2	6	69346	69351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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166	NC_002678	CGG	2	6	69371	69376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_002678	GTGGC	2	10	109115	109124	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
288	NC_002678	GCGCG	2	10	109150	109159	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
289	NC_002678	CGG	2	6	109182	109187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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291	NC_002678	GCCG	2	8	109248	109255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
292	NC_002678	AGA	2	6	110008	110013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_002678	GA	3	6	115228	115233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
299	NC_002678	TGA	2	6	117466	117471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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414	NC_002678	AG	3	6	158908	158913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
415	NC_002678	GCG	3	9	158919	158927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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417	NC_002678	CG	3	6	158986	158991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
418	NC_002678	GATC	2	8	159033	159040	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
419	NC_002678	GCA	2	6	159074	159079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
420	NC_002678	TGC	2	6	159109	159114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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422	NC_002678	GGC	2	6	159430	159435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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